Dans ce projet, le département PHASE de l’INRA collabore avec l’Iowa State University (ISU, James Reecy and Cary Park) faisant elle-même partie d’un consortium incluant Rat Genome Database (RGD) et Mouse Genome Informatics (MGI), deux consortiums américains ayant une finalité « santé humaine » et regroupant eux-mêmes diverses bases de données dédiées à ces deux espèces.

Ont également participé au projet ATOL, des partenaires européens au travers de contrats avec l’UE comme EADGENE (European Animal Disease Genomics Network of Excellence) pour la santé animale ou dans une moindre mesure SABRE (Cutting Edge Genomics for Sustainable Animal Breeding) pour la reproduction bovine, ainsi qu’AQUAEXCEL (AQUAculture infrastructures for EXCELLence in European Fish research) pour l’élevage des poissons.